De werkzaamheden van de SER ten aanzien van toezicht en bestuur vinden plaats onder (gedelegeerde) verantwoordelijkheid van twee commissies; de Bestuurskamer (BK) en de Toezichtkamer (TZK). Voor elk kalenderjaar wordt er door beide commissies een werkprogramma opgesteld (bij de TZK wordt het werkprogramma Toezichtplan genoemd). Hierin wordt een overzicht gegeven van de geplande projectmatige werkzaamheden. De notities die uit deze werkzaamheden voortvloeien zijn ofwel:
- specifieke projecten waarvan de uitkomsten ter vaststelling of besluitvorming aan de BK en de TZK worden voorgelegd, ofwel
- bedoeld om de BK en de TZK in bredere zin te informeren over onderwerpen die voor toezicht en bestuur van belang zijn
Activiteiten van uitvoerende aard in het kader van de Wet op de bedrijfsorganisatie (onder meer de goedkeuring van verordeningen en instemming met besluiten van product- en bedrijfschappen) blijven daarin buiten beschouwing, net als projecten die zich gedurende het jaar aandienen.
Zie voor het werkprogramma van de BK en het Toezichtplan van de TZK de links in de rechter kantlijn.